صادق آملی لاریجانی، از عضویت در شورای نگهبان کناره‌گیری کرد و علی خامنه‌ای، رهبر ایران امروز جمعه ۱۳ شهریور، حسینی‌خراسانی را به عضویت شورای نگهبان منصوب کرد.
اختلاف جدی آملی لاریجانی در شورای نگهبان بعد از رد صلاحیت بردارش علی لاریجانی در انتخابات اخیر ریاست‌جمهوری مطرح شد.
لاریجانی اعتبارنامه ریاست جمهوری ابراهیم رئیسی را نیز امضاء نکرده بود.
در تصاویری که شورای نگهبان از زمان امضای اعتبارنامه ریاست جمهوری ابراهیم رئیسی منتشر کرده بود، صادق لاریجانی دیده نمی‌شد.
طبق تصاویری که از صدا و سیمای ایران از مراسم تحلیف ابراهیم رئیسی پخش شد، صادق آملی لاریجانی و علی لاریجانی در مراسم تحلیف ابراهیم رئیسی حضور نداشتند.
صادق لاریجانی، عضو فقهای شورای نگهبان و رئیس مجمع تشخیص مصلحت نظام پس از رد صلاحیت برادرش علی لاریجانی، برای انتخابات ریاست جمهوری، شورای نگهبان را متهم کرد که تحت نفوذ سازمان‌ها و نهادهای اطلاعاتی ایران (وزارت اطلاعات و سازمان اطلاعات سپاه) قرار دارد.