سعید نمکی در نامه‌‌ای به رئیس جمهور که در رسانه های ایرانی انتشار یافته در رابطه با اقدام ناگهانی وزارت صنعت مبنی بر ابلاغ دستورالعمل بازگشایی کلیه مشاغل و مراکز کسب‌وکار به شدت انتقاد کرد.
وی در این نامه با اشاره به اینکه «مدت‌‌هاست گروهی شبانه‌روز در حال تدوین پروتکل‌‌های متعدد جهت محیط‌‌های مختلف اجتماعی، اداری، کسب‌وکار، خدماتی و علمی و فرهنگی هستند» به یک باره بدون اطلاع ستاد نامه‌‌ای توسط وزارت صنعت به کلیه استان‌‌ها ابلاغ شده که عملاً دستورالعمل اداری برای بازگشایی کلیه مشاغل و مراکز کسب‌وکار تلقی میشود.»
آقای نمکی با انتقاد به این دستورالعمل گفت: «این شیوه با نقش، مسئولیت و جایگاه ستاد ملی مقابله با کرونا مغایرت دارد.»
وی همچنین گفت: «هر گونه تصمیم آتش به‌اختیار توسط هر دستگاه دولتی، غیردولتی، فرهنگی، مذهبی و غیره که مورد تأیید نباشد شعله‌‌هایش به‌سرعت دامن نظام سلامت و متعاقب آن اقتصاد کشور را خواهد گرفت.»
وزیر بهداشت با اشاره به پیامدهای این تصمیم گفت: «کوچکترین حرکت نسنجیده و غیرمنطبق با نظر کارشناسی آسیب‌‌های غیر قابل جبرانی در پی خواهد داشت که حداقل در نظام سلامت امکان ایستادن در مقابل هجمه‌‌هایش میسر نیست.»
با این حال قائم مقام وزارت صنعت با اشاره به اینکه نباید در سال «جهش تولید» تولید را تعطیل کرد افزوده است: «اصل کار و تولید کشور، آن هم در سالی که به نام سال جهش تولید نام‌گذاری گردیده است، تعطیل‌پذیر نیست.»
در رابطه با موضوع مدیریت بحران کرونا مقام‌ها و نهادهای مختلف جمهوری اسلامی بارها درباره اینکه نهادهای موازی هرکدام تصمیمی برای خود می‌گیرند انگشت اتهام را به سوی یکدیگر گرفته‌اند.
