بهنام شیخی در اسفندماه سال ۱۳۹۲ به اتهام شرکت در مراسم زبان مادری به همراه اکبر آزاد، علیرضا فرشی و حمید منافی سه تن دیگر از شرکت کنندگان در این مراسم بازداشت و پس از آن در سال ۱۳۹۵ توسط دادگاه انقلاب بهارستان به ۱۰ سال حبس تعزیری و ۲ سال تبعید به ازنا از توابع استان لرستان محکوم شده بود.
پس از اعتراض آقای شیخی به حکم ۱۰ سال حبس تعزیری و ۲ سال تبعید که از بابت اتهام «مشارکت در تشکیل جمعیت به منظور برهم زدن امنیت کشور» صادر شده بود، از سوی شعبه ۵۴ دادگاه تجدید نظر تهران به ۲ سال حبس تعزیری و ۲ سال تبعید کاهش یافت.
«بهنام شیخی سامانلو»، «علیرضا فرشی دیزج‌یکان» و «حمید منافی نظرلو»، در تاریخ ۳۱ تیر ۱۳۹۹ در شهر تهران با ضرب و شتم بازداشت و جهت تحمل حبس به زندان اوین منتقل شدند.
بهنام شیخی برادر بزرگ مهرداد شیخی دیگر فعال آذربایجانی است که هم اکنون در زندان مرکزی اردبیل در حال گذراندن دوران محکومیت ۶ ماهه خود می‌باشد.