آروتیونیان به‌عنوان یکی از عاملان جنگ دوم قاراباغ و عامل اصلی حمله موشکی به شهر گنجه که در جریان این جنگ، ده‌ها غیرنظامی کشته شدند، تحت پیگرد بود.
بازداشت این تروریست همزمان است با سومین سالگرد حمله موشکی ارمنستان به شهر گنجه که با فرمان آرائیک آروتیونیان صورت گرفت.
دادستانی کل آذربایجان در بیانیه ای با اعلام آغاز روند بازجویی از متهم حمله موشکی به شهر گنجه تاکید داشت که گام‌های قاطع دولت آذربایجان تنها به محاکمه آرائیک هاروتونیان محدود نخواهد شد و تمامی تروریست‌ها باید به خاطر جنایات خود در برابر قوانین آذربایجان پاسخگو باشند.
رسانه‌های آذربایجان چهارشنبه، اولین تصاویر از لحظه بازداشت آرائیک را که در تلاش برای فرار از خانکندی به ایروان بود را منتشر کردند.
هاروتونیان که خود را رهبر ارامنه ساکن در قاراباغ می نامد در جنگ 44 روزه قاراباغ نیز به ایروان گریخته بود.
